با نگاه به کتاب «خاطرات آیت الله خلخالی»؛
من حاکم شرع بودم و پانصد و چند نفر از جانیان و سرسپردگان رژیم شاه را محاکمه و اعدام کردم و صدها نفر از عوامل غائلههای کردستان و گنبد و خوزستان و شماری از عوامل اشرار و قاچاقچیان مواد مخدر را هم کشتم. و اکنون در مقابل این اعدامهایی که کردم، نه پشیمانم و نه گلهمند و نه دچار عذاب وجدانم
به گزارش اصفهان زیبا؛ کتاب خودنوشت «خاطرات آیت الله خلخالی، اولین حاکم شرع دادگاه های انقلاب»، در دو جلد، به سال 1380 (چاپ پنجم) توسط نشر سایه منتشر شده است. این خاطرات که قبل از چاپ، به صورت یک ستون ثابت در روزنامه اصلاح طلب «سلام» منتشر شده است، در زمان خود نقدها و واکنش های مختلفی را برانگیخته است. بسیاری از نقدها مربوط به لحن کتاب است که به نظر میرسد درباره افراد با لحن زنندهای سخن میگوید.