تغییر رویه قرآن، در برخورد با یهودیان مدینه، پاسخی مستقیم به اقدامات خصمانه و عهدشکنیهای مکررآنها مثل توطئهچینی برای ترور پیامبر و همکاری با دشمنان و... بود.
برخی آیات قرآن میگویند تنها توبه جهل به گناه پذیرفته میشود اما آیات دیگر می گوید حتی توبه کسانی را که آگاهانه مرتکب گناه شدهاند نیز پذیرفتهشده میداند.
رآن در نقل دیدگاههای نادرست، با آوردن قرینههایی چون «وجدها» در آیه ۸۶ کهف، نشان میدهد که گزارش صرفاً بازتاب ادراک شخصی (ذوالقرنین) است و نه بیان حقیقت علمی.
اختلاف در تفسیر و ترجمه آیات ۵ تا ۸ طارق، که برخی با علم ناسازگارند، ناشی از فهم بشری است و با وجود تفسیرهای علمیپذیر، این امر خطایی در قرآن بهشمار نمیآید.
به دلیل تفاوت موضوع، آیات شش روز آفرینش (خلق آسمانها و زمین) با آیات هشت روز (خلق همراه با کوهها، برکات زمین، مواد غذایی و قضاء آسمانها) در تعارض نیستند.