به گزارش گروه دانشگاه خبرگزاری دانشجو، پژوهشگران دانشکده زیستشناسی با همکاری دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر دانشکدگان علوم دانشگاه تهران موفق به طراحی و ابداع نرمافزار پیشبینی تمایل شکلگیری تجمعات پپتیدی و پروتئینی با عنوان SqFt شدند.
این دستاورد طی همکاری بینرشتهای خانم فاطمه اشعاری پژوهشگر آزمایشگاه بیوتکنولوژی پروتئین با پژوهشگران رشتههای آمار و نیز مهندسی شیمی دانشگاه تهران به راهنمایی مشترک مهران حبیبی رضایی استاد دانشکده زیستشناسی و سودابه شمه سوار دانشیار دانشکده ریاضی آمار و علوم کامپیوتر دانشگاه تهران محقق شده است.
حبیبی رضایی، سرپرست این گروه پژوهشی، در خصوص اهمیت این دستاورد اظهار داشت: در شرایط استرس اکسیداتیو، بسیاری از پروتئینها و پپتیدهای طبیعی با عملکردهای معلوم و بعضاً نامعلوم دارای درجات متفاوت تمایل به تشکیل تجمع آمیلوئیدی هستند. در نتیجه تشکیل تجمعات آمیلوئیدی، عملکرد طبیعی پروتئینها از بین رفته و بعضاً سمی مرگرسیون لجستیک (Logistic Regression) مدل طراحی و از ۳۵۴ هگزاپپتید جهت آزمون نرمافزار استفاده و به منظور بررسی کارآیی مدل از شاخصها و آنالیزهای آماری بهرهبرداری شد. در ادامه، کارآیی و پایایی مدل ابداع شده طی مقایسه کمیتهای محاسباتی مورد نظر با مقادیر بدست آمده از سرورهای رایج و شناختهشده مانند Aggrescan، WALTZ، Metamyl و PASTA۲.۰ به اثبات رسید.