به گزارش گروه فناوری خبرگزاری دانشجو، متیلاسیون DNA باکتریایی در توالیهای متنوعی اتفاق میافتد و نقش مهمی در دفاع سلولی و تنظیم ژن ایفا میکند. مطالعات مختلفی گزارش شده است که متیلاسیون DNA باکتریایی نقش مهمی در عملکرد باکتریها مانند میزان حمله به میزبان و تشکیل بیوفیلم دارد.
متیلومهای باکتریایی حاوی سه شکل اولیه متیلاسیون DNA هستند: N ۶-متیلادین، N ۴-متیل سیتوزین و ۵-متیل سیتوزین. توالییابی بیسولفیت برای نقشهبرداری متیلاسیون DNA در ژنوم پستانداران چندان موثر نیست.
به تازگی محققان یک روش جدید ارائه کردهاند که در آن از توالییابی نانوحفرهای برای شناسایی متیلاسیونهای مختلف استفاده میشود. محققان این روش را برای باکتریهای منفرد و میکروبهای موجود در روده استفاده کردند. در این پروژه پژوهشگران با استفاده از متیلاسیون DNA اقدام به تجزیه و تحلیل میکروبیوم با وضوح بالا، نقشهبرداری از عناصر ژنتیکی کردند.
چرا نتایج . برای مهار موثر قدرت درمانی میکروبیوم، درک گونههای خاص باکتریها و سویههای خاص در میکروبیوم انسان بسیار مهم است. روش جدید محققان، ترکیبی از قدرت توالییابی طولانی مدت و متیلاسیون DNA باکتری برای مطالعه نمونههای پیچیده میکروبیوم در گونهها است.
با بررسی سه نوع متیلاسیون DNA در نمونههای مختلف، پژوهشگران دریافتند که سیگنال توالییابی مبتنی بر نانوحفره ناهمگنی پیچیدهای را در متیلاسیونهای یک نمونه نشان میدهد. برای دستیابی به این پیچیدگی و امکان استفاده از توالییابی با نانوحفره برای کشف متیلاسیون، محققان یک مجموعه داده از گونههای باکتریایی ایجاد کردند و یک روش جدید برای شناسایی و نقشهبرداری از سه شکل متیلاسیون DNA ارائه کردند.