علاوه بر افت کیفیت علمی پیام نور، رعایت نشدن نسبت استاد به دانشجو در این دانشگاه و نگرانی برخی کارشناسان از ایجاد رشتههای کاربردی و مهندسی از دیگر چالشهای این دانشگاه است.
گروه دانشگاه خبرگزاری دانشجو-زینب امیدی، امروز در موردش حرفهای زیادی زده میشود، «وامانده از رسالت خویش»، «کارخانه تولید مدرک» ،«مواجهه با افت شدید کیفیت»، «رشد قارچ گونه مراکز و شعبات» این بازخود عملکرد دانشگاهی است که در دهه شصت سبک جدیدی از تحصیل را در ایران به راه انداخت و در اساس نامه خود اعلام کرد فلسفه وجودیش جذب و پذیرش افرادی است که قادر به تحصیل در سایر دوره های دانشگاهی نیستند و نمیتوانند حضور فیزیکی و تمام وقت در دانشگاه داشته باشند مانند کارمندان و زنان خانه دار، تا این افراد بتوانند به صورت مجازی در دانشگاه تحصیل کنند. این شروع کار دانشگاه پیام نور بود.
