اختلاف بر سر مبلغ قرارداد، امضای قرارداد محمد خلیفه با استقلال را به تعویق انداخته و مذاکرات دو طرف همچنان ادامه دارد.
باشگاه استقلال پس از پیوستن بهرام گودرزی و تمدید قرارداد علیرضا کوشکی با انتشار کلیپی به هوادارانش پیغام داد که چشم برندارند که معنایش جذب بازیکن جدید بود.
در همین راستا، باشگاه آلومینیوم اراک در بیانیهای از صدور رضایتنامه برای گودرزی و محمد خلیفه برای پیوستن به استقلال خبر داد و همگان تصور کردند که باشگاه استقلال به زودی از خلیفه رونمایی خواهد کرد، اما این اتفاق نیفتاد.