وی بر اهمیت تقویت ابعاد مختلف اخلاقی اشاره نمود و اظهار داشت: لازم است تا طلاب علوم دینی برای نهادینه سازی شاکله سبک زندگی و زیست اجتماعی اسلام؛ بر مقدمات عبادات، جهان النفس، کتاب العشره و… مسلط باشند.
مدیر حوزههای علمیه ضمن تأکید بر تقویت نشاط اجتماعی و بزرگداشت اعیاد اسلامی به ویژه عید غدیر، با بیان این که عزاداری اهل بیت (علیهم السلام) نوعی شادی و فرح معنوی ایجاد مینماید، خاطرنشان کرد: باید ضمن تعمیق حدیث خوانی و تأکید بر آن در حوزههای علمیه؛ دوره نظام جامع اندیشه اسلامی را که در دو سال برگزاری، اثرات خوبی در مدارس دینی داشته، تقویت نماییم.
آیت الله اعرافی ضمن ارائه گزارشی از پژوهشهای صورت گرفته در رابطه با ۴۰۰ رشته و گرایش در حوزه علوم اسلامی، بحث امامت و ولایت با محوریت مهدویت را از پایههای مباحث تاریخی در درختواره رشتههای حوزه دانست.