اسطوخودوس با وجود فواید فراوان، این گیاه همانند بسیاری از گیاهان دارویی، می تواند در برخی شرایط اثرات نامطلوبی داشته باشد. مصرف بی رویه، استفاده در افراد خاص (مانند کودکان، زنان باردار و بیماران خاص)، یا مصرف همزمان با برخی داروها، می تواند منجر به بروز عوارض جدی و گاهی خطرناک شود.
البته کسانی که طبع گرم دارند هم می توانند از آن استفاده کنند، فقط کافی است مقدار مصرف شان کمتر باشد تا بهترین نتیجه را بگیرند و دچار عوارض نشوند.
