امیر قلعهنویی ۱۷ سال قبل محمد مایلیکهن را تهدید کرد و با تاکید بر اینکه او حرف بیربطی در مورد قهرمانی استقلال زده، مدعی شد میان آنها همه چیز از دادگاه مشخص خواهد شد.
بعد از بازی جنجالی و پرحاشیه استقلال و سایپا که ۲۷ فروردین ۱۳۸۸ برگزار شد و طی آن گروهی از هواداران استقلال به شدت علیه محمد مایلیکهن، سرمربی وقت سایپا موضع گرفتند، این مربی بدون اسم بردن از امیر قلعهنویی مدعی شد که خط داده بودند تا علیه او شعار دهند!
حاجیمایلی همچنین در مورد قهرمانی استقلال در جام حذفی نیز تاکید داشت که این اتفاق مشکوک بوده است؛منظور مایلیکهن قهرمانی استقلال در جام حذفی سال ۸۷ بود.