اختلاف میان باشگاه استقلال و مجتبی جباری در مقطعی کار را به جنگ بیانیهها کشاند.
پس از قهرمانی استقلال در لیگ دوازدهم همه فکر میکردند که مجتبی جباری در این تیم ماندگار خواهد شد و اختلافات گذشتهاش با فتحاللهزاده و امیر قلعهنویی به تاریخ پیوسته اما جباری تصمیم دیگری گرفت و مسیرش را به سمت اصفهان کج کرد!
اوایل تیر سال ۹۲ خبر آمد که سپاهان به طور جدی با مجتبی وارد مذاکره شده است و این قضیه جنبه واقعیت نیز به خود پیدا کرد. جباری مصاحبه کنایهآمیزی پیرامون باشگاه استقلال انجام داد و این باشگاه نیز چهارم تیر سال ۹۲ بیانیه بسیار تندی علیه مجتبی منتشر کرد و صراحتا گفت مجتبی دیگر در لیست استقلال قرار ندارد.