محمد مایلیکهن اول اردیبهشت ۱۳۸۸ به دلیل نوشتن بیانیههای جنجالی از هدایت تیم ملی فوتبال ایران کنار گذاشته شد!
یکی از عجیبترین تحولات در تیم ملی ایران، اول اردیبهشت ماه ۱۳۸۸ رقم خورد و محمد مایلیکهن بعد از فقط ۱۷ روز تصدی سمت سرمربیگری این تیم و بدون برگزاری حتی یک مسابقه رسمی و دوستانه، این پست را از دست داد.
اختلافات میان محمد مایلیکهن و امیر قلعهنویی بعد از بازی حساس و جنجالی ۲۷ فروردین ۱۳۸۸ به اوج خود رسید و حاجیمایلی که در آن مقطع به صورت همزمان هدایت سایپا و تیم ملی را بر عهده داشت، با انتشار یک بیانیه تند مدعی شد عدهای به هواداران استقلال خط دادند تا علیه او شعار سر داده شود. او همچنین قهرمانی استقلال در جام حذفی سال ۸۷ را نیز مورد سوال قرار داده و آن را مشکوک دانست.
