یکی از مشکلات اکتشاف عدم مدیریت یکپارچه است. برای انجام پروژه اکتشاف در یک معدن باید همزمان از چندین بخش دولتی مجوز اخذ کرد. سازمان محیط زیست، وزارت صمت و سازمان انرژی اتمی که در تعیین تکلیف پهنههای معدنی صاحب اختیار هستند، از همین دست بخشهای دولتیاند که برای اخذ مجوز باید رضایت هر سه ارگان را جلب کرد.