آیت الله لاریجانی ترور ناجوانمردانه دانشمند هسته ای-دفاعی کشور و فقدان شهید فخری زاده را ضایعهای سخت برای کشور و نظام اسلامی ایران توصیف کرد و با تاکید بر اینکه “دشمنان مردم ایران با این قبیل ترورهای ناجوانمردانه نمیتوانند مسیر توسعه و پیشرفت ایران را سد کنند”گفت:راه و رویکرد شهید فخری زاده و سایر دانشمندان شهید کشور توسط سایر نخبگان و فرزندان علمی کشور ادامه خواهد یافت و حاصل چنین اقدامات ناجوانمردانهای که از جانب دشمنان مردم و نظام جمهوری اسلامی سر میزند؛ رسوایی بیشتر و آشکار شدن برخوردهای عجیب و دوگانه آنان با مفهوم حقوق بشر و موضوع تروریسم است.
رییس مجمع تشخیص مصلحت نظام با اشاره به اینکه “برخی کشورهای غربی که دائما دیگران را به حمایت از تروریسم متهم میکنند، در جریان ترور آشکار، واضح و کاملا ضد انسانی اخیرسکوت کردند” تصریح کرد:متاسفیم که امروز قدرتهای مدعی دنیا با معیارها و سیاستهای متناقض و دوگانه دم از حقوق بشر میزنند.
آیت الله لاریجانی متهم اصلی این جنایت را رژیم صهیونیستی دانست و گفت: البته واضح است که برخی سیستمهای اطلاعاتی و جاسوسی کشورهای غربی و اذناب آنها نیز شریک جرم این جنایت تلخ و ضد انسانی هستند.