بسیج دانشجویی شهید شاهچراغی دانشگاه پیام نور شیراز در نامهای به امت اسلامی نوشت: از مسئولان و علما و مراجع انتظار میرود سکوت را بشکنند و در محکومیت جنایت آل سعود لب به سخن بگشایند.
عضو هیئت علمی گروه علوم سیاسی دانشگاه تهران گفت:راهکارهای سیاسی و دیپلماسی باید مد نظر حکومتهای منطقه قرار گیرد و حکام منطقه باید بدانند که با رفتارهای خشونتآمیز راه به جایی نخواهند برد.
دبیر انجمن اسلامی دانشجویان دانشگاه زنجان با اشاره به صدور مجوز اعدام شیخ نمر گفت: رژیم آل سعود باید بداند که آستانه تحمل مسلمانان حدی دارد و بترسند از روزی که با پاسخ سخت و خشن ما مواجه شوند.
دانش آموخته دانشگاه مذاهب اسلامی گفت: شیخ نمر در سالهای گذشته نیز چندین بار دستگیر شده است که در یکی از این اتهامات جرم وی فقط شرکت در یک همایش قرآنی در بحرین عنوان شده است. «اعدام با شمشیر و به صلیب کشیده شدن در انظار عمومی حد ساختگی که در هیچ جای دنیا چنین حدی به این موهن بودن وجود ندارد و این حکم نیز نقض آشکار حقوق بشر است.»
مسئول سیاسی خواهران بسیج دانشجویی دانشگاه علوم پزشکی زنجان با اشاره به صدور مجوز اعدام شیخ نمر گفت: آل سعود به دلیل جنایات اخیر خود، نزد ملتهای مسلمان منفور بود که با صدور مجوز اعدام شیخ نمر خود را منفورتر از گذشته کرد.
خبرگزاری میزان-جامعه مدرسین حوزه علمیه قم با انتشار اطلاعیهای در اعتراض به تأیید حکم اعدام شیخ نمر باقر النمر، خواستار آزادی شیخ نمر و خروش همه مسلمانان و علمای جهان اسلام در برابر رأی اعدام وی شد.
خبرگزاری میزان-جامعه روحانیت مبارز با صدور بیانیهای تاکید کرد که اگر آلسعود بی عقلی کرده و آقای نمر را اعدام کند خون آقای نمر بجوش خواهد آمد و جوشش خون آقای نمر هستههای مقاومت را شکل می دهد