یکی از مراجع تقلید در پیامی به مناسبت شهادت آیت الله شیخ باقرالنمر عنوان کرد: وقت آن رسیده که امت بزرگ اسلامی با هر سلیقه و فکری، برای نابودی چرثومه فساد و نماینده مزدور آمریکا به پا خیزد.
سپاه در بیانیهای تاکید کرد: اقدام خباثت آمیز و جنایت کارانه رژیم آل سعود در به شهادت رساندن آیت الله شیخ نمر باقر النمر رهبر شیعیان عربستان، بخشی از یک توطئه صهیونیستی است.
در اطلاعیه جامعه مدرسین برای شهادت شیخ نمر آمده است: خون آن شهید سعید دامن منحوس سردمداران سعودی را فرا خواهد گرفت و بیتردید راه شیخ نمرها بیرهرو نخواهد ماند.
عضو کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس گفت:حکام رژیم سعودی با اقدامات خصمانه اخیر خود از جمله اعدام شیخ نمر در یک سراشیبی تندی قرار گرفتهاند که این سراشیبی آنها را به قعر جهنم و اسفل سافلین میکشاند.
دفتر تحکیم وحدت ضمن محکوم کردن اعدام شیخ نمر اعلام کرد: به شهادت رسیدن شیخ باقر النمر، رهبر بزرگ و آزادیخواه شیعیان عربستان به دست رژیم سفاک سعودی، بدون شک آغازی است بر پایان رژیم خونخوار، فاسد و دست نشانده سعودی.