در پی انتخاب حضرت آیت الله سید مجتبی حسینی خامنهای (مدظله العالی) از سوی مجلس خبرگان رهبری به عنوان سومین رهبر جمهوری اسلامی، رئیس مجلس شورای اسلامی در پیامی تاکید کرد:ما این جایگاه را نیابت مولایمان حضرت ولی عصر (عج الله تعالی فرجه الشریف) میدانیم و در همراهی و تبعیت از این ولی فقیه زمان، تفاوتی بین معظم له با امام کبیرمان و امام شهیدمان قائل نیستیم و این وظیفه را واجب قطعی شرعی و ملی خود میدانیم.
در پی شهادت رهبر ایران اسلامی ، چندی است نام سید مجتبی حسینی خامنهای، فرزند دوم ایشان ، در بسیاری از رسانه ها به عنوان یکی از چهره های تاثیر گذار در ایران مطرح شده است .
سپاه پاسداران انقلاب اسلامی در بیانیهای تاکید کرد: سپاه پاسداران به عنوان سرباز و بازوی مقتدر ولایت ضمن حمایت از انتخاب مجلس محترم خبرگان رهبری، آماده اطاعت کامل و جانفشانی اوامر الهی ولای فقیه زمان حضرت آیتالله سیدمجتبی خامنهای و حفظ ارزشهای انقلاب اسلامی و صیانت از میراث گرانبهای امامین انقلاب حضرت امام خمینی رضوان الله تعالی علیه و امام خامنهای رحمةالله علیه است.
در ویدیویی که چندی پیش منتشر شده آقا سید مجتبی خامنهای فرزند رهبر معظم انقلاب در حالی که در آن زمان پدر بزرگوارش رئیسجمهور وقت بودند، برای دفاع از ایران به جبههها رفت.