سخنگوی کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس در واکنش به ترور محسن فخری زاده در فضای مجازی نوشت: ترور دانشمندان هسته ای، برنامه اتمی ایران را به عقب نمیبرد.
مشاور مقام معظم رهبری در پیامی شهادت محسن فخری زاده را تسلیت گفت و نوشت: به شهادت رساندن ایشان توسط دشمنان بیانگر عمق کینه آنان نسبت به فرزندان برومند ملت ایران است.
فرمانده کل ارتش در پی ترور شهید فخری زاده، با صدور پیامی نوشت: این اقدامات جنایتکارانه هرگز نمیتوانند ملت بزرگ ایران را از راه پیشرفت و توسعه صلح جویانه بازدارند.