بسیج دانشجویی شهید شاهچراغی دانشگاه پیام نور شیراز در نامهای به امت اسلامی نوشت: از مسئولان و علما و مراجع انتظار میرود سکوت را بشکنند و در محکومیت جنایت آل سعود لب به سخن بگشایند.
احمد خاتمی با اشاره به شخصیت والا و علمی آیت الله نمر گفت: با وجود تلاشهای ایشان در دفاع از اسلام هنوز جامعه به درستی این عالم را نشناخته است و باید جامعه دانشگاهی به رسالت خود در معرفی شخصیت برجسته این عالم شیعه بپردازد و شیخ نمر را به جامعه معرفی کند.
دانش آموخته دانشگاه مذاهب اسلامی گفت: شیخ نمر در سالهای گذشته نیز چندین بار دستگیر شده است که در یکی از این اتهامات جرم وی فقط شرکت در یک همایش قرآنی در بحرین عنوان شده است. «اعدام با شمشیر و به صلیب کشیده شدن در انظار عمومی حد ساختگی که در هیچ جای دنیا چنین حدی به این موهن بودن وجود ندارد و این حکم نیز نقض آشکار حقوق بشر است.»
دبیر مجمع عدالتخواه دانشگاههای شیراز گفت: دولتمردان ایران اسلامی باید در برابر اعدام شیخ نمر که یک اقدام استکباری عربستان است، مواضع قاطع اتخاذ کنند.
دبیر آموزش اتحادیه جامعه اسلامی دانشجویان کشور گفت: ما از دولتمردان هیچ توقعی نداریم؛ چرا که دولت کاری نکند بهتر است به دلیل اینکه نهایت کاری که میکند زانو زدن در برابر دشمن است.
دانشکده علوم قرآنی شیراز در بیانیهای ضمن محکومیت شهادت شیخ نمر نوشت: تا آخر در کنار شیعیان مظلوم عربستان خواهد ایستاد و علاوه بر دعوت از مسلمانان عربستان برای قیام علیه نظام حاکم و فاسد این کشور، آنان را به همدلی و اتحاد فرا میخواند.
بسیج دانشجویی شهرستان سروستان اعلام کرد: از وزارت امورخارجه و علمای دلسوز شیعه خواستاریم این اقدامات ضد تشیع را پیگیری و بر حفظ حقوق مسلمانان و شیعیان در جوامع بین الملل تاکیده ورزیده و نگذارند خون برادرانمان پایمال گردد.