مارکو باکیچ از برخی رفتارهای همبازیانش شاکی است چون بر این باور است که برخی بازیکنان از قصد به او پاس نمی دهند.
مارکو باکیچ قطعا یکی از بهترین خریدهای پرسپولیس در نقلوانتقالات تابستانی است که بارها کیفیت فنی خود را نشان داده اما یکمصدومیت بدموقع در دیدار با استقلال خوزستان در نیمفصل اول و ضعف کادر پزشکی پرسپولیس، باعث شد مارکو از روزهای اوج خود فاصله بگیرد.
طبق شنیده ها، مارکو باکیچ از برخی موضوعات ناراحت است و در مورد این اتفاق با نزدیکان خود هم صحبت کرده است. باکیچ باور دارد پس از بازگشت از مصدومیت، برخی بازیکنان پرسپولیس او را از جریان بازی خارج کردهاند.