به جریان افتادن پرونده مبهم سامانه ثبت حقوق و مزایا و اعلام رسمی سازمان اداری و استخدامی نشان داد که همچنان برخی دستگاهها که تعدادشان کم هم نیست حتی حاضر به ورود به سامانه نشده و هیچ اقدامی جهت شفافسازی پرداختها نکردهاند. در کنار آن دستگاههایی مانند دیوان محاسبات و مجلس که مکلف به نظارت بر این جریان هستند، خودشان هم اطلاعی از وضعیت پرداختهایشان ارائه ندادهاند.
به گزارش ایسنا، راه انداری سامانه ثبت حقوق و مزایا و ایجاد شفافیت در پرداختها، زمانی به برنامه ششم توسعه آمد و در ماده ۲۹ به تکلیفی برای دستگاههای مشمول تبدیل شد که قبل از آن ماجرای فیشهای نجومی پیش آمده و چالش و حواشی بسیاری ایجاد کرده بود؛ از این رو قرار شد با راهاندازی این سامانه دستگاهها به سمت شفاف سازی پیشبروند ولی آنچه که در این سالها اتفاق افتاد نشانی از عملکرد مثبت و دقیق در این رابطه نداشت.