پس از پیروزی انقلاب اسلامی در بهمن ۱۳۵۷ ، اداره شرکت های دارویی چند ملیتی از جمله بایر فارما ایران در تیر ۱۳۵۹ به مدیران منتخب دولت واگذار گشته و شرکت تحت پوشش سازمان صنایع ملی ایران، تحت نام پارس دارو (سهامی خاص) قرار گرفت.
در سال ۱۳۶۳ طی موافقتی که بین سازمان صنایع ملی ایران و۷۶ درصدی شرکت بایر به سازمان صنایع ملی ایران / شرکت بایر آ.گ آلمان صورت پذیرفت، مالکیت ۲۵ انتقال یافت. سرمایه گذاری ۶۴ درصدی در ساخت کارخانه داروسازی فارابی در اصفهان و بهره برداری از آن در سال ۱۳۷۳ ، موفقیت شایان توجهی برای حفظ و ارتقاء وضعیت مالی شرکت بوده است. شرکت توانست در سال ۱۳۷۴ با تغییر وضعیت از سهامی خاص به سهامی عام، وارد بورس اوراق بهادار تهران شود.