در سری اول دیدیم که یک سامورایی خارجی با موهای روشن به اسم ویلیام به عنوان شخصیت اصلی در داستان حضور داشت؛ اما در Nioh ۲ قهرمان اصلی تغییر کرده است. در این بازی شما میتوانید شخصیت مورد نظرتان را که ترکیبی از انسان و یوکای (در فرهنگ ژاپنی به معنی روح) است به سلیقه خودتان بسازید. ماجراهای این بازی در دوران باستانی ژاپن و در سال ۱۵۵۵ رخ میدهند.