شهید محمود امیرخانی ابتدا در دانشگاه فردوسی مشهد تحصیل کرد و پس از مدتی با فراهم شدن شرایط برای ادامه تحصیل به فلیپین میرود و با کمک دوستان هم عقیدهاش، انجمن اسلامی دانشجویان را در آن کشور تاسیس کرد.
به گزارش خبرنگار خبرگزاری دانشجو از مشهد، شهید محمود امیرخانی در فروردین ماه سال ۱۳۲۹در خانوادهای مذهبی متولد شد. پدرش با فروش پارچه، زندگی نسبتاً خوبی برای خانوادهاش تامین کرده بود. او و همسرش که افرادی معتقد و مذهبی بودند در تربیت و پرورش فرزندانشان حداکثر تلاش را کردند تا آنها را مومن و معتقد به اصول مذهبی بار آوردند.
پس از اخذ دیپلم، محمود به خدمت سربازی رفت و با درجه گروهبانی، در پادگانی در حومه زادگاهش مشهد خدمت میکند. مطالعه گسترده، حضور در مجالس مذهبی و نشستن پای سخنرانی اشخاص متدین و روشنفکر، باعث شده بود تا با ذهنی روشن با مسائل جامعهاش بر خورد کند.