اختلاف میان مدیران وقت باشگاه استقلال و امیر قلعهنویی در پاییز سال ۱۳۸۸ به اوج خود رسیده بود.
در اوایل پاییز سال ۱۳۸۸ باشگاه استقلال جشنی را برگزار کرد که در آن از چهرهها و سرمربیان اسبق این تیم یاد شد ولی نامی از امیر قلعهنویی برده نشد! این اتفاق در حالی رخ داد که آبیپوشان با قلعهنویی در بهار همان سال قهرمان هشتمین دوره رقابتهای لیگ برتر شده بودند اما پس از آن این مربی ترجیح داد جدا شود چون به لحاظ کاری با امیررضا واعظی آشتیانی مدیرعامل وقت باشگاه استقلال کنار نمیآمد.
در همین خصوص اختلافات میان قلعهنویی و مدیران استقلال تا جایی بالا گرفت که ۲۳ مهر سال ۸۸ بیانیه تند باشگاه استقلال پیرامون شکل عقد قرارداد با بازیکنان این تیم در لیگ هشتم منتشر شد و…
