در مرحله نهایی، پس از تایید صلاحیت‌های فنی و علمی، ساختار اقتصادی شرکت‌ها مورد واکاوی قرار می‌گیرد. کارشناسان با بررسی دقیق میزان درآمد عملیاتی و سطح بلوغ تجاری، شرکت‌ها را در یکی از دسته‌های نوپا، نوآور یا فناور طبقه‌بندی می‌کنند. این نظام رتبه‌بندی به منظور تخصیص هدفمند تسهیلات، معافیت‌های مالیاتی و حمایت‌های دولتی متناسب با ظرفیت هر مجموعه طراحی شده است. متقاضیان واجد شرایط می‌توانند جهت ثبت‌نام و آغاز فرآیند ارزیابی، به سامانه‌های رسمی شبکه کسب‌وکارهای دانش‌بنیان مراجعه کنند.