با توجه به اینکه روان درمانی تأثیر عمیقی بر هیجان، رفتار و شناخت هر فرد دارد، انتظار می‌رود که بر عملکرد مغز و حتی ساختار آن تأثیر بگذارد. امروزه با حجم عظیمی از تحقیقات در مورد تأثیر روان درمانی بر مغز مواجه هستیم.